生物信息學(Bioinformatics)是一門利用應用數學、信息學、統計學和計算機科學的方法研究生物學的問題的學科,側重于生物學領域中計算方法的使用和發展。目前的生物信息學基本上只是分子生物學與信息技術(尤其是互聯網技術)的結合體。生物信息學的研究材料和結果就是各種各樣的生物學數據,其研究工具是計算機,研究方法包括對生物學數據的搜索(收集和篩選)、處理(編輯、整理、管理和顯示)及利用(計算、模擬)。目前主要的研究方向有:序列比對、基因識別、基因重組、蛋白質結構預測、基因表達、蛋白質反應的預測,以及建立進化模型。*(1)
生物學技術往往生成大量的嘈雜數據。與數據挖掘類似,生物信息學利用數學工具從大量數據中提取有用的生物學信息。生物信息學所要處理的典型問題包括:重新組裝在霰彈槍定序法測序過程中被打散的DNA序列,從蛋白質的氨基酸序列預測蛋白質結構,利用mRNA微陣列或質譜儀的數據檢驗基因調控的假說。
生物信息學與計算生物學
有些人將計算生物學作為生物信息學的同義詞處理;但也有些人認為計算生物學和生物信息學應當被當作不同的條目處理,因為生物信息學更側重于生物學領域中計算方法的使用和發展,而計算生物學強調應用信息學技術對生物學領域中的假說進行檢驗,并嘗試發展新的理論。
注:右表排名為2014年USNEWS遺傳學、基因組學及生物信息學排名,醫學家不包括流行病專家的薪水。
大學排名
排名 | 學校中文名 | 英文名 | 州/地區 |
1 | Stanford University | Stanford, CA | |
2 | Massachusetts Institute of Technology | Cambridge, MA | |
3 | Harvard University | Boston, MA | |
4 | University of California–?Berkeley | Berkeley, CA | |
5 | University of Washington | Seattle, WA | |
5 | Washington University in St. Louis | St. Louis, MO | |
7 | Johns Hopkins University | Baltimore, MD | |
8 | 加州大學舊金山分校 | University of California–?San Francisco | San Francisco, CA |
8 | Yale University | New Haven, CT | |
10 | Princeton, NJ |
注:以上排名為2014年USNEWS遺傳學、基因組學及生物信息學排名
參考資料:
(1) Molecular genetics Wikipedia
(2) Biological Scientists, All Other US Bureau of Labor Statistics
(3) Best Genetics / Genomics / Bioinformatics Program 2013-2014 USNEWS
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