| 排名 | 學校中文名 | 學校英文名 | 國家/地區 |
| 1 | 哈佛大學 | Harvard University | 美國 |
| 2 | 麻省理工學院 | Massachusetts Institute of Technology | 美國 |
| 3 | 斯坦福大學 | Stanford University | 美國 |
| 4 | 劍橋大學 | University of Cambridge | 英國 |
| 5 | 牛津大學 | University of Oxford | 英國 |
| 6 | 加州大學伯克利分校 | University of California, Berkeley | 美國 |
| 7 | 普林斯頓大學 | Princeton University | 美國 |
| 8 | 耶魯大學 | Yale University | 美國 |
| 9 | 哥倫比亞大學 | Columbia University | 美國 |
| 10 | 加州理工學院 | California Institute of Technology | 美國 |
| 11 | 芝加哥大學 | University of Chicago | 美國 |
| 12 | 東京大學 | University of Tokyo | 日本 |
| 13 | 加州大學洛杉磯分校 | University of California, Los Angeles | 美國 |
| 14 | 密歇根大學安娜堡分校 | University of Michigan | 美國 |
| 15 | 帝國理工學院 | Imperial College London | 英國 |
| 16 | 賓夕法尼亞大學 | University of Pennsylvania | 美國 |
| 17 | 康奈爾大學 | Cornell University | 美國 |
| 18 | 清華大學 | Tsinghua University | 中國 |
| 19 | 蘇黎世聯邦理工學院 | ETH Zurich – Swiss Federal Institute of Technology Zurich | 瑞士 |
| 20 | 倫敦大學學院 | University College London | 英國 |
| 21 | 北京大學 | Peking University | 中國 |
| 22 | 約翰霍普金斯大學 | Johns Hopkins University | 美國 |
| 23 | 多倫多大學 | University of Toronto | 加拿大 |
| 24 | 倫敦政治經濟學院 | London School of Economics and Political Science | 英國 |
| 25 | 紐約大學 | New York University | 美國 |
| 26 | 新加坡國立大學 | National University of Singapore | 新加坡 |
| 27 | 京都大學 | Kyoto University | 日本 |
| 28 | 杜克大學 | Duke University | 美國 |
| 29 | 華盛頓大學 | University of Washington | 美國 |
| 30 | 伊利諾伊大學厄本那-香檳分校 | University of Illinois at Urbana-Champaign | 美國 |
| 30 | 莫斯科國立大學 | Lomonosov Moscow State University | 俄羅斯 |
| 30 | 西北大學 | Northwestern University | 美國 |
| 33 | 卡耐基梅隆大學 | Carnegie Mellon University | 美國 |
| 34 | 德克薩斯大學奧斯汀分校 | University of Texas at Austin | 美國 |
| 35 | 威斯康辛大學麥迪遜分校 | University of Wisconsin-Madison | 美國 |
| 35 | 加州大學圣地亞哥分校 | University of California, San Diego | 美國 |
| 37 | 英屬哥倫比亞大學 | University of British Columbia | 加拿大 |
| 38 | 愛丁堡大學 | University of Edinburgh | 英國 |
| 39 | 麥吉爾大學 | McGill University | 加拿大 |
| 40 | 佐治亞理工學院 | Georgia Institute of Technology | 美國 |
| 40 | 慕尼黑大學 | LMU Munich | 德國 |
| 42 | 加州大學舊金山分校 | University of California, San Francisco | 美國 |
| 43 | 倫敦大學國王學院 | King’s College London | 英國 |
| 44 | 賓州州立大學公園分校 | Pennsylvania State University | 美國 |
| 45 | 加州大學戴維斯分校 | University of California, Davis | 美國 |
| 45 | 香港大學 | University of Hong Kong | 香港 |
| 45 | 首爾國立大學 | Seoul National University | 韓國 |
| 48 | 洛桑聯邦理工學院 | École Polytechnique Fédérale de Lausanne | 瑞士 |
| 49 | 曼徹斯特大學 | University of Manchester | 英國 |
| 49 | 墨爾本大學 | University of Melbourne | 澳大利亞 |
| 49 | 明尼蘇達大學雙城分校 | University of Minnesota | 美國 |
| 51-60 | 代爾夫特理工大學 | Delft University of Technology | 荷蘭 |
| 51-60 | 海德堡大學 | Heidelberg University | 德國 |
| 51-60 | 柏林洪堡大學 | Humboldt University of Berlin | 德國 |
| 51-60 | 卡羅琳學院 | Karolinska Institute | 瑞典 |
| 51-60 | 馬里蘭大學學院公園分校 | University of Maryland, College Park | 美國 |
| 51-60 | 北卡羅來納大學教堂山分校 | University of North Carolina at Chapel Hill | 美國 |
| 51-60 | 俄亥俄州立大學 | Ohio State University | 美國 |
| 51-60 | 大阪大學 | Osaka University | 日本 |
| 51-60 | 普渡大學西拉法葉分校 | Purdue University | 美國 |
| 51-60 | 慕尼黑工業大學 | Technical University of Munich | 德國 |
| 61-70 | 阿姆斯特丹大學 | University of Amsterdam | 荷蘭 |
| 61-70 | 澳洲國立大學 | Australian National University | 澳大利亞 |
| 61-70 | 巴黎高等師范學院 | École Normale Supérieure | 法國 |
| 61-70 | 魯汶大學（荷語） | KU Leuven | 比利時 |
| 61-70 | 密歇根州立大學 | Michigan State University | 美國 |
| 61-70 | 南加州大學 | University of Southern California | 美國 |
| 61-70 | 悉尼大學 | University of Sydney | 澳大利亞 |
| 61-70 | 東北大學（日本） | Tohoku University | 日本 |
| 61-70 | 圣路易斯華盛頓大學 | Washington University in St Louis | 美國 |
| 71-80 | 波士頓大學 | Boston University | 美國 |
| 71-80 | 布朗大學 | Brown University | 美國 |
| 71-80 | 加州大學圣塔芭芭拉分校 | University of California, Santa Barbara | 美國 |
| 71-80 | 香港中文大學 | Chinese University of Hong Kong | 香港 |
| 71-80 | 柏林自由大學 | Free University of Berlin | 德國 |
| 71-80 | 復旦大學 | Fudan University | 中國 |
| 71-80 | 香港科技大學 | Hong Kong University of Science and Technology | 香港 |
| 71-80 | 匹茲堡大學 | University of Pittsburgh | 美國 |
| 71-80 | 上海交通大學 | Shanghai Jiao Tong University | 中國 |
| 71-80 | 德州農工大學 | Texas A&M University | 美國 |
| 81-90 | 印第安納大學伯明頓分校 | Indiana University (Bloomington) | 美國 |
| 81-90 | 韓國高等科技學院 | Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) | 韓國 |
| 81-90 | 萊頓大學 | Leiden University | 荷蘭 |
| 81-90 | 倫敦商學院 | London Business School | 英國 |
| 81-90 | 南洋理工大學 | Nanyang Technological University | 新加坡 |
| 81-90 | 國立臺灣大學 | National Taiwan University | 臺灣 |
| 81-90 | 巴黎第六大學 | Pierre and Marie Curie University | 法國 |
| 81-90 | 亞琛工業大學 | RWTH Aachen University | 德國 |
| 81-90 | 圣彼得堡國立大學 | Saint Petersburg State University | 俄羅斯 |
| 81-90 | 東京工業大學 | Tokyo Institute of Technology | 日本 |
| 81-90 | 華威大學 | University of Warwick | 英國 |
| 81-90 | 浙江大學 | Zhejiang University | 中國 |
| 91-100 | 亞利桑那州立大學 | Arizona State University | 美國 |
| 91-100 | 科羅拉多大學博爾德分校 | University of Colorado Boulder | 美國 |
| 91-100 | 巴黎高等理工學院 | École Polytechnique | 法國 |
| 91-100 | 歐洲工商管理學院 | Insead | 法國 |
| 91-100 | 隆德大學 | Lund University | 瑞典 |
| 91-100 | 莫斯科物理技術學院 | Moscow Institute of Physics and Technology | 俄羅斯 |
| 91-100 | 巴黎第一大學 | Panthéon-Sorbonne University – Paris 1 | 法國 |
| 91-100 | 圣保羅大學 | University of São Paulo | 巴西 |
| 91-100 | 烏得勒支大學 | Utrecht University | 荷蘭 |
| 91-100 | 瓦格寧根大學 | Wageningen University and Research Center | 荷蘭 |
參考資料：World Reputation Rankings 2016 Times Higher Education