| 排名 | 學校名稱 | 學校英文名 | 國家/地區 |
| 1 | 哈佛大學 | Harvard University | 美國 |
| 2 | 麻省理工學院 | Massachusetts Institute of Technology (MIT) | 美國 |
| 3 | 上海交通大學 | Shanghai Jiao Tong University | 中國 |
| 4 | 斯坦福大學 | Stanford University | 美國 |
| 5 | 帝國理工學院 | Imperial College London | 英國 |
| 6 | 倫敦大學學院 | University College London | 英國 |
| 7 | 新加坡國立大學 | National University of Singapore | 新加坡 |
| 8 | 密歇根大學安娜堡分校 | University of Michigan | 美國 |
| 9 | 約翰霍普金斯大學 | Johns Hopkins University | 美國 |
| 10 | 匹茲堡大學 | University of Pittsburgh | 美國 |
| 11 | 佐治亞理工學院 | Georgia Institute of Technology | 美國 |
| 12 | 蘇黎世聯邦理工學院 | ETH Zurich | 瑞士 |
| 13 | 賓夕法尼亞大學 | University of Pennsylvania | 美國 |
| 14 | 多倫多大學 | University of Toronto | 加拿大 |
| 15 | 烏得勒支大學 | Utrecht University | 荷蘭 |
| 16 | 清華大學 | Tsinghua University | 中國 |
| 17 | 魯汶大學（荷語） | KU Leuven | 比利時 |
| 18 | 首爾大學 | Seoul National University (SNU) | 韓國 |
| 19 | 奈梅亨大學 | Radboud University Nijmegen | 荷蘭 |
| 20 | 哥倫比亞大學 | Columbia University | 美國 |
| 21 | 浙江大學 | Zhejiang University | 中國 |
| 22 | 南洋理工大學 | Nanyang Technological University | 新加坡 |
| 23 | 四川大學 | Sichuan University | 中國 |
| 24 | 慕尼黑工業大學 | Technical University of Munich | 德國 |
| 25 | 西北大學 | Northwestern University | 美國 |
| 26 | 伯爾尼大學 | University of Bern | 瑞士 |
| 27 | 悉尼大學 | University of Sydney | 澳大利亞 |
| 28 | 米蘭理工大學 | Polytechnic University of Milan | 意大利 |
| 29 | 牛津大學 | University of Oxford | 英國 |
| 30 | 蘇黎世大學 | University of Zurich | 瑞士 |
| 31 | 北卡羅來納大學教堂山分校 | University of North Carolina Chapel Hill | 美國 |
| 32 | 北京大學 | Peking University | 中國 |
| 33 | 加州大學圣地亞哥分校 | University of California San Diego | 美國 |
| 34 | 特文特大學 | University of Twente | 荷蘭 |
| 35 | 華盛頓大學 | University of Washington Seattle | 美國 |
| 36 | 艾茉莉大學 | Emory University | 美國 |
| 37 | 高麗大學 | Korea University | 韓國 |
| 38 | 柏林自由大學 | Free University of Berlin | 德國 |
| 39 | 麥吉爾大學 | McGill University | 加拿大 |
| 40 | 蘇州大學 | Suzhou University | 中國 |
| 41 | 柏林洪堡大學 | Humboldt University of Berlin | 德國 |
| 42 | 埃因霍溫理工大學 | Eindhoven University of Technology | 荷蘭 |
| 43 | 柏林查理特醫科大學 | Charite Medical University of Berlin | 德國 |
| 44 | 加州大學洛杉磯分校 | University of California Los Angeles | 美國 |
| 45 | 蒙特利爾大學 | University of Montreal | 加拿大 |
| 46 | 埃爾朗根-紐倫堡大學 | University of Erlangen Nuremberg | 德國 |
| 47 | 倫敦大學國王學院 | Kings College London | 英國 |
| 48 | 墨爾本大學 | University of Melbourne | 澳大利亞 |
| 49 | 復旦大學 | Fudan University | 中國 |
| 50 | 西安交通大學 | Xi'an Jiaotong University | 中國 |
| 51 | 亞琛工業大學 | RWTH Aachen University | 德國 |
| 52 | 海德堡大學 | Ruprecht Karls University Heidelberg | 德國 |
| 53 | 英屬哥倫比亞大學 | University of British Columbia | 加拿大 |
| 54 | 杜克大學 | Duke University | 美國 |
| 55 | 凱斯西儲大學 | Case Western Reserve University | 美國 |
| 56 | 威斯康辛大學麥迪遜分校 | University of Wisconsin Madison | 美國 |
| 57 | 波爾圖大學 | Universidade do Porto | 葡萄牙 |
| 58 | 圣保羅大學 | Universidade de Sao Paulo | 巴西 |
| 59 | 米尼奧大學 | Universidade do Minho | 葡萄牙 |
| 60 | 洛桑聯邦理工學院 | Ecole Polytechnique Federale de Lausanne | 瑞士 |
| 61 | 俄亥俄州立大學 | Ohio State University | 美國 |
| 62 | 根特大學 | Ghent University | 比利時 |
| 63 | 中山大學 | Sun Yat Sen University | 中國 |
| 64 | 明尼蘇達大學雙城分校 | University of Minnesota Twin Cities | 美國 |
| 65 | 阿姆斯特丹自由大學 | Vrije Universiteit Amsterdam | 荷蘭 |
| 66 | 康奈爾大學 | Cornell University | 美國 |
| 67 | 昆士蘭科技大學 | Queensland University of Technology (QUT) | 澳大利亞 |
| 68 | 謝菲爾德大學 | University of Sheffield | 英國 |
| 69 | 塔夫斯大學 | Tufts University | 美國 |
| 70 | 代爾夫特理工大學 | Delft University of Technology | 荷蘭 |
| 71 | 索邦大學 | Sorbonne Universite | 法國 |
| 72 | 猶他大學 | University of Utah | 美國 |
| 73 | 圣路易斯華盛頓大學 | Washington University (WUSTL) | 美國 |
| 74 | 加州大學伯克利分校 | University of California Berkeley | 美國 |
| 75 | 維克森林大學 | Wake Forest University | 美國 |
| 76 | 賓州州立大學公園分校 | Pennsylvania State University | 美國 |
| 77 | 東京大學 | University of Tokyo | 日本 |
| 78 | 劍橋大學 | University of Cambridge | 英國 |
| 79 | 昆士蘭大學 | University of Queensland | 澳大利亞 |
| 80 | 吉林大學 | Jilin University | 中國 |
| 81 | 國立臺灣大學 | National Taiwan University | 臺灣 |
| 82 | 德累斯頓工業大學 | Technische Universitat Dresden | 德國 |
| 83 | 慕尼黑大學 | University of Munich | 德國 |
| 84 | 馬來亞大學 | Universiti Malaya | 馬來西亞 |
| 85 | 耶魯大學 | Yale University | 美國 |
| 86 | 都柏林圣三一學院 | Trinity College Dublin | 愛爾蘭 |
| 87 | 加州大學戴維斯分校 | University of California Davis | 美國 |
| 88 | 曼徹斯特大學 | University of Manchester | 英國 |
| 89 | 延世大學 | Yonsei University | 韓國 |
| 90 | 武漢大學 | Wuhan University | 中國 |
| 91 | 伊利諾伊大學厄本那-香檳分校 | University of Illinois Urbana-Champaign | 美國 |
| 92 | 南加州大學 | University of Southern California | 美國 |
| 93 | 香港大學 | University of Hong Kong | 香港 |
| 94 | 華中科技大學 | Huazhong University of Science & Technology | 中國 |
| 95 | 弗萊堡大學 | University of Freiburg | 德國 |
| 96 | 卡爾加里大學 | University of Calgary | 加拿大 |
| 97 | 伊拉斯姆斯大學 | Erasmus University Rotterdam | 荷蘭 |
| 98 | 博洛尼亞大學 | University of Bologna | 意大利 |
| 99 | 佛羅里達大學 | University of Florida | 美國 |
| 100 | 德黑蘭醫科大學 | Tehran University of Medical Sciences | 伊朗 |
參考資料：2019-2020 Biomedical Engineering Ranking URAP